從臨床與基礎的研究中發現有關的因素很多目前一般認為發病可能與神經精神障礙病毒感染或自身免疫有關有報告家族中有同樣患者是否與遺傳有關尚無確證應用鏈霉素異煙肼氯磺苯脲甲磺丁脲等可發生扁平苔蘚樣皮疹或促使該病加劇口腔扁平苔蘚病因病理改變可概括為：角化過度與角化不全伴粒層肥厚基底細胞壞死液化變性及基底膜下有大量淋巴細胞浸潤此外有時在棘層基底層或結締組織內可看到圓形的嗜酸性膠狀體其體積小于棘細胞但膠狀體也可見于盤狀紅斑狼瘡等多種疾病在電鏡下可見基底細胞的橋粒與半橋粒的松解變性于是導致大量炎癥細胞浸潤并在基底細胞與基底膜分離的空隙中形成上皮下水皰變性的橋粒可能成為抗原而引起自身免疫反應所以在直接免疫熒光檢查下有時能在基底膜區出現由免疫復合物沉積所產生的熒光此外還可看到基底膜的改變；不規則增厚斷裂與重新形成；基底膜斷裂使炎癥細胞進入棘層棘層內的膠狀體可能是被巨噬細胞所吞噬的變性或死亡的上皮細胞口腔扁平苔蘚屬中醫“口蕈”范疇[1]中醫認為該病屬于陰血不足虛損積熱化火血虛生風產燥致使肌膚粘膜失其濡養；或因思慮傷脾脾失健運濕熱瘀滯蘊熱化火；或為肝郁氣滯蘊熱化火；或肝腎陰虛陰虛火旺虛火上炎所致另外加以風濕熱三邪蘊于肌膚不得疏泄可誘發加重該病